Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms