Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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