Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFLP07196 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFLP07196 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFLP07196 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFLP07196 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFLP07196 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFLP07196 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFLP07196 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFLP07196 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFLP07196 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFLP07196 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFLP07196 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFLP07196 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFLP07196 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFLP07196 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFLP07196 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFLP07196 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFLP07196 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFLP07196 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEFLP07196 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFLP07196 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFLP07196 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFLP07196 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFLP07196 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFLP07196 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFLP07196 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFLP07196 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFLP07196 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFLP07196 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFLP07196 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFLP07196 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFLP07196 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFLP07196 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFLP07196 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFLP07196 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFLP07196 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFLP07196 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFLP07196 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFLP07196 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFLP07196 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFLP07196 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFLP07196 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEFLP07196 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFLP07196 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFLP07196 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFLP07196 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFLP07196 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFLP07196 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFLP07196 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFLP07196 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFLP07196 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFLP07196 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFLP07196 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFLP07196 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFLP07196 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFLP07196 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFLP07196 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFLP07196 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFLP07196 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFLP07196 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFLP07196 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFLP07196 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFLP07196 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFLP07196 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFLP07196 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFLP07196 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFLP07196 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFLP07196 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFLP07196 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEFLP07196 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFLP07196 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFLP07196 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFLP07196 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFLP07196 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFLP07196 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFLP07196 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFLP07196 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFLP07196 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFLP07196 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFLP07196 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFLP07196 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFLP07196 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFLP07196 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFLP07196 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFLP07196 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFLP07196 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFLP07196 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFLP07196 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFLP07196 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFLP07196 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFLP07196 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEFLP07196 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFLP07196 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFLP07196 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFLP07196 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFLP07196 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFLP07196 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFLP07196 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFLP07196 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFLP07196 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms