Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATE1O95260 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATE1O95260 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATE1O95260 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms