Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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PRAMEF10O60809 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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PRAMEF10O60809 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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PRAMEF10O60809 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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PRAMEF10O60809 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF10O60809 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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