Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN2O60636 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms