Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLXNC1O60486 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PLXNC1O60486 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PLXNC1O60486 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLXNC1O60486 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLXNC1O60486 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLXNC1O60486 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PLXNC1O60486 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLXNC1O60486 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLXNC1O60486 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLXNC1O60486 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLXNC1O60486 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLXNC1O60486 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLXNC1O60486 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms