Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DENRO43583 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DENRO43583 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DENRO43583 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DENRO43583 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DENRO43583 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DENRO43583 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DENRO43583 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DENRO43583 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DENRO43583 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DENRO43583 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DENRO43583 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DENRO43583 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DENRO43583 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DENRO43583 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DENRO43583 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DENRO43583 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DENRO43583 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DENRO43583 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DENRO43583 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DENRO43583 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DENRO43583 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DENRO43583 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DENRO43583 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DENRO43583 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DENRO43583 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DENRO43583 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DENRO43583 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DENRO43583 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DENRO43583 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
DENRO43583 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DENRO43583 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DENRO43583 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DENRO43583 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DENRO43583 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DENRO43583 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DENRO43583 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DENRO43583 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms