Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGSM2O43147 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGSM2O43147 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms