Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf172C9J069 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms