Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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ARL2-SNX15V9GYD0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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ARL2-SNX15V9GYD0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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ARL2-SNX15V9GYD0 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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ARL2-SNX15V9GYD0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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ARL2-SNX15V9GYD0 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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ARL2-SNX15V9GYD0 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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ARL2-SNX15V9GYD0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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ARL2-SNX15V9GYD0 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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ARL2-SNX15V9GYD0 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ARL2-SNX15V9GYD0 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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