Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.05■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms