Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BIVM-ERCC5R4GMW8 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms