Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP15Q9Y4E8 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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