Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms