Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF8Q9UPP1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms