Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms