Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms