Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NPC1L1Q9UHC9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms