Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D6

FAM135A, Protein FAM135A, humanhuman

Predictions only

Length 1,515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM135AQ9P2D6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM135AQ9P2D6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms