Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms