Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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RDH8Q9NYR8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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RDH8Q9NYR8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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RDH8Q9NYR8 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RDH8Q9NYR8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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