Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN6Q9NWW5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms