Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB9

ACKR4, Atypical chemokine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR4Q9NPB9 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACKR4Q9NPB9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACKR4Q9NPB9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACKR4Q9NPB9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACKR4Q9NPB9 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACKR4Q9NPB9 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACKR4Q9NPB9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACKR4Q9NPB9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACKR4Q9NPB9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACKR4Q9NPB9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACKR4Q9NPB9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACKR4Q9NPB9 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACKR4Q9NPB9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACKR4Q9NPB9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACKR4Q9NPB9 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACKR4Q9NPB9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR4Q9NPB9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR4Q9NPB9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR4Q9NPB9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR4Q9NPB9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR4Q9NPB9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR4Q9NPB9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR4Q9NPB9 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR4Q9NPB9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACKR4Q9NPB9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms