Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE7BQ9NP56 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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