Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRHQ9HD43 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms