Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms