Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms