Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SALL3Q9BXA9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms