Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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