Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRSF8Q9BRL6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms