Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA1CQ9BQE3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms