Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPA33Q99795 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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