Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms