Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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SAMD8Q96LT4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SAMD8Q96LT4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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