Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms