Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCARF2Q96GP6 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms