Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms