Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNX21Q969T3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms