Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC112Q8NEF3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC112Q8NEF3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC112Q8NEF3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC112Q8NEF3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC112Q8NEF3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC112Q8NEF3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC112Q8NEF3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC112Q8NEF3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC112Q8NEF3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC112Q8NEF3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC112Q8NEF3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC112Q8NEF3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC112Q8NEF3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC112Q8NEF3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC112Q8NEF3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC112Q8NEF3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC112Q8NEF3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC112Q8NEF3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC112Q8NEF3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC112Q8NEF3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC112Q8NEF3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC112Q8NEF3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC112Q8NEF3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC112Q8NEF3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC112Q8NEF3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC112Q8NEF3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC112Q8NEF3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC112Q8NEF3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC112Q8NEF3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC112Q8NEF3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms