Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HJURPQ8NCD3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms