Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4T4

ARHGEF39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, humanhuman

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF39Q8N4T4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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ARHGEF39Q8N4T4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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ARHGEF39Q8N4T4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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ARHGEF39Q8N4T4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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ARHGEF39Q8N4T4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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ARHGEF39Q8N4T4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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ARHGEF39Q8N4T4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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ARHGEF39Q8N4T4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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