Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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CLIP4Q8N3C7 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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CLIP4Q8N3C7 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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CLIP4Q8N3C7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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CLIP4Q8N3C7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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CLIP4Q8N3C7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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CLIP4Q8N3C7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLIP4Q8N3C7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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CLIP4Q8N3C7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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CLIP4Q8N3C7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CLIP4Q8N3C7 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CLIP4Q8N3C7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CLIP4Q8N3C7 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CLIP4Q8N3C7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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