Protein–RNA interactions for Protein: Q8N140

EID3, EP300-interacting inhibitor of differentiation 3, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EID3Q8N140 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EID3Q8N140 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms