Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms