Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms