Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCDC84Q86UT8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms