Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TCF23Q7RTU1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms