Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms