Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms